Penyelenggaraan Vaksinasi ini dalam rangka upaya sekolah dalam membantu program pencegahan dan pengendalian penyebaran Covid 19 baik dilingkungan sekolah maupun di lingkungan keluarga. Tahap 1 dilaksanakan bulan Januari dan dilanjutkan tahap 2 pada tanggal 7 Februari 2022. Pelaksanaan vaksinasi berjalan dengan lancar, hal ini terselenggara atas kerjasama Puskesmas Umbulharjo dan pihak sekolah yang didukung oleh pihak Kapanewon Umbuharjo dan wali siswa.
Orang tua Siswa menyambut dengan baik inisiatif sekolah dalam menyelenggarakan kegiatan vaksinasi di sekolah untuk para siswa. Hal ini sangat membantu orang tua dalam mendapatkan vaksinasi bagi putra putrinya, sehingga tidak perlu ke Puskesmas ataupun lokasi lokasi vaksinasi yang biasanya harus antri banyak. Adapun saat pelaksanaannya, siswa cukup datang ke sekolah sesuai jadwal jam yang ditentukan.Dan selesai vaksinasi maka siswa diperbolehkan untuk pulang beritirahat di rumah masing-masing.
Sejak awal pelaksanaan PTM, SDIT Luqman Al Hakim 2 Yk sangat peduli terhadap pelaksanaan Protokol kesehatan dalam rangka melindungi keluarga besar sekolah. Dimulai dari aturan cek suhu, pemakaian handsanitiser, cuci tangan, penggunaan masker dengan benar, dan lain – lain. Bahkan kepada guru – guru dan karyawan juga diwajibkan untuk melaksanakan vaksinasi sebagaimana himbauan dari pemerintah. Hal ini sebagai upaya agar orang tua menjadi nyaman ketika putra putrinya belajar di sekolah.